Bestyrelsen består af ni personer, som er udpeget af ejerkredsen bag Det Syddanske EU-Kontor (Region Syddanmark, samtlige 22 kommuner i regionen og Syddansk Universitet).
Borgmester Johnny Søtrup, Esbjerg Kommune, formand
Regionsrådsmedlem Karsten Uno Petersen, Region Syddanmark, næstformand
Borgmester Anker Boye, Odense Kommune
Borgmester Arne Sigtenbjerggaard, Vejle Kommune
1. viceborgmester Søren Peschardt, Vejle Kommune
Regionsrådsmedlem Thies Mathiasen, Region Syddanmark
Dekan Simon Møberg Torp, Syddansk Universitet
Direktør Bo Stærmose, Syddansk Vækstforum
Regionsrådsmedlem Sonny Berthold, Region Syddanmark